2011/11/20

R/Bioconductor のパッケージ作成に役立つリンク集

From Evernote:

R/Bioconductor のパッケージ作成に役立つリンク集

R や Bioconductor のパッケージ作成について、参考になりそうなリンク集を集めました。

Creating R Packages: A Tutorial
Rパッケージ作成に関するチュートリアルのテキスト。これを一通りやれば作れるようになる。S3, S4 classes についても書いてある。R5 classes については書いてない。

Building Packages
http://www.bioconductor.org/help/course-materials/2010/AdvancedR/BuildPackage.pdf
R packages 作成に必要な基礎知識をまとめた資料。プレゼン形式なので要点がまとまっていて読みやすい。BioC について一部書いてある。

Building Packages: Self-Study Exercises
同じく Wong さんの資料。パッケージ作成の演習問題。

Seminar III: R/Bioconductor
これもBioCライブラリ作成のレクチャー資料。プレゼン形式。要点がまとまっていてよい。

Authoring R Packages
Rパッケージの仕組みについてのレクチャーの資料。プレゼン形式。BioCについては書いてない。

Bioconductor Developers 
BioCの公式文章がいろいろある。

Writing R Extensions
R拡張の公式文章。namespace とかの話は知っていること前提になるので、これを読んでおこう。

良質な R package のコードを読むよ
拙著。BioCのパッケージガイドラインの貴重な日本語解説:)